Protein–RNA interactions for Protein: P01027

C3, Complement C3, mousemouse

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3P01027 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3P01027 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3P01027 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3P01027 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3P01027 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C3P01027 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
C3P01027 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C3P01027 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C3P01027 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3P01027 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3P01027 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3P01027 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3P01027 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3P01027 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C3P01027 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3P01027 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C3P01027 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C3P01027 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C3P01027 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C3P01027 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
C3P01027 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C3P01027 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C3P01027 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C3P01027 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C3P01027 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C3P01027 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C3P01027 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C3P01027 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C3P01027 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C3P01027 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3P01027 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C3P01027 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C3P01027 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C3P01027 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C3P01027 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3P01027 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3P01027 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3P01027 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms