Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtco2P00405 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms