Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc6O88978 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms