Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setdb1O88974 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms