Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba3O88888 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms