Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BlmO88700 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BlmO88700 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BlmO88700 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BlmO88700 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
BlmO88700 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
BlmO88700 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BlmO88700 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BlmO88700 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BlmO88700 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
BlmO88700 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BlmO88700 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
BlmO88700 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BlmO88700 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
BlmO88700 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BlmO88700 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BlmO88700 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BlmO88700 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BlmO88700 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
BlmO88700 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BlmO88700 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BlmO88700 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BlmO88700 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BlmO88700 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BlmO88700 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BlmO88700 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BlmO88700 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
BlmO88700 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BlmO88700 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BlmO88700 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BlmO88700 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BlmO88700 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BlmO88700 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BlmO88700 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BlmO88700 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
BlmO88700 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
BlmO88700 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
BlmO88700 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
BlmO88700 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
BlmO88700 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BlmO88700 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BlmO88700 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BlmO88700 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BlmO88700 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BlmO88700 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
BlmO88700 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BlmO88700 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BlmO88700 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
BlmO88700 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BlmO88700 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BlmO88700 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BlmO88700 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms