Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cops6O88545 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops6O88545 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops6O88545 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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