Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd2O70572 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd2O70572 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd2O70572 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd2O70572 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd2O70572 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd2O70572 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms