Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubr1O70481 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubr1O70481 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubr1O70481 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubr1O70481 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms