Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms