Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1bO70237 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1bO70237 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms