Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp9aO70228 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms