Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf5O70191 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf5O70191 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf5O70191 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms