Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkbO70126 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkbO70126 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkbO70126 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkbO70126 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AurkbO70126 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AurkbO70126 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkbO70126 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms