Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkbO55229 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms