Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ldb2O55203 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb2O55203 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb2O55203 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms