Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt5hO55201 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Supt5hO55201 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms