Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp2a2O55143 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms