Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap1O55125 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms