Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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