Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nck2O55033 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nck2O55033 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nck2O55033 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nck2O55033 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nck2O55033 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nck2O55033 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nck2O55033 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms