Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Bnip3O55003 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms