Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarce1O54941 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms