Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Socs5O54928 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Socs5O54928 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Socs5O54928 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms