Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limk2O54785 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limk2O54785 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limk2O54785 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms