Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CrxO54751 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CrxO54751 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CrxO54751 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CrxO54751 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CrxO54751 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CrxO54751 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CrxO54751 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CrxO54751 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxO54751 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxO54751 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxO54751 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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