Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp15O54732 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms