Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FxnO35943 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FxnO35943 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FxnO35943 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FxnO35943 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FxnO35943 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FxnO35943 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FxnO35943 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FxnO35943 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FxnO35943 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FxnO35943 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FxnO35943 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FxnO35943 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FxnO35943 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FxnO35943 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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FxnO35943 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FxnO35943 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FxnO35943 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FxnO35943 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FxnO35943 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FxnO35943 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FxnO35943 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FxnO35943 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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