Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pik3cdO35904 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms