Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf12O35738 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf12O35738 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf12O35738 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms