Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp2O35711 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms