Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn1mwO35599 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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