Protein–RNA interactions for Protein: O35437

Tcf21, Transcription factor 21, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf21O35437 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tcf21O35437 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf21O35437 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf21O35437 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf21O35437 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf21O35437 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tcf21O35437 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tcf21O35437 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tcf21O35437 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf21O35437 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tcf21O35437 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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