Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb3O35393 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms