Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn9O35239 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms