Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebi3O35228 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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