Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms