Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scarb2O35114 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms