Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4dO09126 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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