Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn1O08788 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms