Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sec22bO08547 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms