Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4340L7N2C4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4340L7N2C4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4340L7N2C4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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