Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp955bL7N232 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp955bL7N232 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms