Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm2056J3QQ02 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms