Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5294J3QP53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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