Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms