Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21411J3KMS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21411J3KMS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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