Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r12G5E8G1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r12G5E8G1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r12G5E8G1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r12G5E8G1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms