Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r176G3UW31 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r176G3UW31 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms