Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms